Отделение профессионального образования РАО координировало деятельность ряда научно-исследовательских институтов, среди которых в разные годы были:
Учреждение Российской академии образования «Институт информатизации образования» — Роберт И.В., г. Москва;
Учреждение Российской академии образования «Институт образования взрослых» — Триодин В.Е., г. Санкт-Петербург;
Учреждение Российской академии образования «Институт педагогического образования» — Соколова И.И., г. Санкт-Петербург;
Учреждение Российской академии образования «Институт проблем непрерывного образования» — Таюрский А.И., г. Красноярск;
Учреждение Российской академии образования «Институт педагогики и психологии профессионального образования» — Мухаметзянова Г.В., г. Казань;
Учреждение Российской академии образования «Институт национальных проблем в образовании» — Омаров О.А., г. Махачкала