Отделение профессионального образования РАО координировало деятельность ряда научно-исследовательских институтов, среди которых в разные годы были:
Учреждение Российской академии образования «Институт информатизации образования» – Роберт И.В., г. Москва;
Учреждение Российской академии образования «Институт образования взрослых» – Триодин В.Е., г. Санкт-Петербург;
Учреждение Российской академии образования «Институт педагогического образования» – Соколова И.И., г. Санкт-Петербург;
Учреждение Российской академии образования «Институт проблем непрерывного образования» – Таюрский А.И., г. Красноярск;
Учреждение Российской академии образования «Институт педагогики и психологии профессионального образования» – Мухаметзянова Г.В., г. Казань;
Учреждение Российской академии образования «Институт национальных проблем в образовании» – Омаров О.А., г. Махачкала